حصل السيد محمد الهنائي على زمالة شراكة في مركز دراسات السياسة الأوروبية، حيث سيعمل هناك على التعاون التجاري بين الاتحاد الأوروبي ودول مجلس التعاون الخليجي ومفاوضات التجارة الحرة، وأيضا المفاوضات التجارية الثنائية والمتعددة الأطراف بين المنطقتين، من بين أمور أخرى.
محمد الهنائي، في الوقت الراهن، خبيرا لشؤون المنظمات والعلاقات التجارية في المديرية العامة للمنظمات والعلاقات التجارية بوزارة التجارة والصناعة في مسقط في سلطنة عمان. وكان سابقا في المكتب السلطاني (وزارة المكتب السلطاني) (1996 – 2000م)، وفي المجلس الأعلى للتخطيط (وزارة التنمية – سابقا))1990 – 1996م)، حيث مثل سلطنة عمان آنذاك في العديد من المحافل الدولية. حصل على شهادة البكالوريوس في الدراسات الدولية من جامعة جاكسون فيل (الولايات المتحدة الأمريكية)، ويحمل شهادتين في الدراسات العليا (ماجستيرين) إحداهما في الاقتصاد التنموي من كلية ويليمز (الولايات المتحدة الأمريكية)، والأخرى في التنمية الاقتصادية المجتمعية من جامعة نيو همشير الجنوبية (الولايات المتحدة الأمريكية).